Når reglerne ikke bliver fulgt, får virksomheden en anmærkning. Det kan være i form af en indskærpelse, et påbud, et forbud, et bødeforlæg eller en politianmeldelse.
Kontrollen følger op på anmærkninger med ekstra kontrolbesøg.
Normalt kommer kontrollen tilbage én gang. Men det kan være nødvendigt med to eller flere ekstra kontrolbesøg for at sikre, at virksomheden får rettet varigt op.
I nogle få situationer kan opfølgningen ske ved, at virksomheden sender dokumentation til Fødevarestyrelsen til såkaldt 'skrivebordskontrol'.
Opfølgende kontrolbesøg betales af virksomheden.
Kontrolenheden bestemmer, hvornår den opfølgende kontrol skal gennemføres.